Структуру органов местного самоуправления составляют Лесосибирский городской Совет депутатов, Глава города Лесосибирска, администрация города Лесосибирска, контрольно-счетная палата.
Глава города Лесосибирска избирается городским Советом депутатов из числа кандидатов, представленных конкурсной комиссией по результатам конкурса, и возглавляет местную администрацию.
Администрация города Лесосибирска является исполнительно-распорядительным органом местного самоуправления, подотчетным Лесосибирскому городскому Совету депутатов.
Вопросы местного значения городского округа определены в статье 7 Устава города.
